تتمثل مهمة إدارة الجمارك على الخصوص فيما يأتي:[2]
تنفيذ الإجراءات القانونية والتنظيمية التي تسمح بتطبيق موحد للتشريع والتنظيم الجمركيين.[2]
تحصيل الحقوق والرسوم والضرائب المستحقة عند استيراد وتصدير البضائع والعمل على مكافحة الغش والتهرب الجبائيين.[2]
مكافحة المساس بحقوق الملكية الفكرية والاستيراد والتصدير غير المشروعين للممتلكات الثقافية.[2]
المساهمة في حماية الاقتصاد الوطني وضمان مناخ سليم للمنافسة بعيدا عن كل ممارسة غير شرعية.[2]
ضمان إعداد إحصائيات التجارة الخارجية وتحليلها ونشرها.[2]
السهر، طبقا للتشريع والتنظيم الساريين المفعول على: حماية الحيوان والنبات، المحافظة على المحيط.[2]
مكافحة التهريب.[3]
مكافحة الاستيراد والتصدير غير المشروعين للبضائع التي تمس بالأمن والنظام العموميين.[3]
القيام بالتنسيق مع المصالح المختصة، بمكافحة تبييض الأموال والجريمة العابرة للحدود.[3]
التأكد من أن البضائع المستوردة أو الموجهة للتصدير قد خضعت لإجراءات مراقبة المطابقة، وذلك طبقا للتشريع والتنظيم اللذين تخضع لهما.[2]